Araştırma Amaçlı Kullanılabilir Model Organizmalara Ait Mutant ve Klon Koleksiyonlarımız

Araştırma Amaçlı Kullanılabilir Model Organizmalara Ait Mutant ve Klon Koleksiyonlarımız
 
KEIO (Knockout) Mutant Koleksiyonu – Escherichia coli
Gen Sayısı: 3985
Plate Sayısı: 48
Açıklama:
Keio koleksiyonu, E. coli K-12 BW25113 suşu (MG1655) temelinde oluşturulmuş, her biri tek bir geni silinmiş mutant suşlardan oluşur. Her mutantta hedef genin yerine KanR (kanamisin direnci) kaseti yerleştirilmiştir. Bu kaset, pCP20 plazmidinden ifade edilen FLP rekombinaz enzimiyle çıkarılarak hedef genin çerçeve içi (in-frame) silinmesi sağlanabilir.

Koleksiyon listeleri için Bknz. KEIO Koleksiyonu: Plate ve Gen Dizilimi Tablosu
 


ASKA Klon Koleksiyonu GFP+ / GFP- – Escherichia coli
Gen Sayısı: 4123
Plak Sayısı: 57 (her iki versiyon için ayrı ayrı)
Açıklama:
ASKA koleksiyonu, E. coli K-12 W3110 suşuna ait tüm açık okuma çerçevelerinin (ORF'ler) yüksek kopyalı pCA24N plazmidine klonlanmasıyla oluşturulmuştur. Bu plazmid, IPTG ile indüklenebilen T5-lac promotor içerir ve kloramfenikol direnci (CamR) taşır.
GFP+ versiyonu, ORF'lerin C-terminaline GFP etiketi eklenmiştir.
GFP- versiyonu, GFP etiketi içermeyen orijinal klonlardır.

Koleksiyon listeleri için Bknz. ASKA Koleksiyonu: Plate ve Gen Dizilimi Tablosu
 


Bacillus subtilis Knockout Mutant Koleksiyonu
Gen Sayısı: 3968
Plak Sayısı: 45
Açıklama:
Gram pozitif model organizma Bacillus subtilis’e ait bu mutant koleksiyon, Koo ve arkadaşları tarafından oluşturulmuştur. Koleksiyon, farklı genleri silinmiş 3968 mutant suştan oluşur ve çeşitli genetik ve fizyolojik çalışmalarda kullanılmak üzere tasarlanmıştır.

Koleksiyon listeleri için Bknz. Bacillus subtilis Koleksiyonu: Plate ve Gen Dizilimi Tablosu
 


Staphylococcus aureus Transpozon Mutant Koleksiyonu
Gen Sayısı: 2343
Plak Sayısı: 25
Açıklama:
Bu koleksiyon, Staphylococcus aureus suşuna ait yaklaşık 2343 adet dizisi doğrulanmış transpozon mutant klonu içermektedir. Klonlar, E. coli DH10B-T1 hücrelerine aktarılmış şekilde saklanmaktadır ve 25 plakta düzenlenmiştir.

Koleksiyon listeleri için Bknz. Staphylococcus aureus Koleksiyonu: Plate ve Gen Dizilimi